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本発明は、未分化細胞が混入するか混入のおそれがある分化細胞集団から、未分化細胞のアポトーシスを誘導することにより、未分化細胞を除去もしくは低減する方法に関し、該分化細胞集団に色素上皮由来因子（PEDF）を接触させることを含む。本発明は、網膜色素上皮（RPE）細胞から分泌されるPEDFがiPS細胞の増殖を阻害しアポトーシスを誘導することの発見に基づく。