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本発明は、多能性幹細胞の分化の度合いを判別する方法であり、多能性幹細胞の撮影画像に基づいて平坦度を決定するステップと、決定した平坦度に基づいて多能性幹細胞の分化の度合いを判別するステップを含む。具体的には、細胞表面又は細胞集団の表面がより平坦であれば、細胞はより未分化であり、細胞表面又は細胞集団の表面がより平坦でなければ、細胞はより分化したものである。