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本発明は、ＥＳ細胞またはｉＰＳ細胞の判定方法に関し、一定のスフィンゴ糖脂質群、一定の遊離オリゴ糖群、一定のグリサミノグリカン群、一定のＯ－結合型糖鎖群から選択される少なくとも１つの糖鎖について被験細胞における該糖鎖の量を測定する工程を含む。