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本発明は、複数の外来遺伝子並びに薬剤選択マーカー及び／又はレポーター遺伝子のｉＰＳ細胞への効果的なトランスフェクション方法と、該方法によって製造される前記外来遺伝子を１００％発現する胚様体の形成方法に関するものであり、以下の工程を含む：１）エピソーマルベクターを用いて、ｉＰＳ細胞に該外来遺伝子を非リポソーム型カチオン性脂質トランスフェクション試薬を用いてトランスフェクションする工程；２）該外来遺伝子がトランスフェクションされたｉＰＳ細胞を、薬剤選択マーカー及び／又はレポーター遺伝子を用いて選別する工程；および３）選別されたｉＰＳ細胞を、非静的な培養方法で培養し、胚様体まで増殖させる工程。